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SPRIselect (비드 기반 시약)

Description
· 40개 이상의 NGS 라이브러리 준비 키트에 제안된 SPRIselect 시약은 로트 간 편차를 최소화하면서 DNA 크기 선택 과정에서 유연성과 제어를 제공
· 실온에서 안정적

본문

개요

고품질의 염기서열 분석 데이터를 생성하는데 중요한 NGS 라이브러리 

준비 과정에서 크기 선택 단계를 보다 효과적으로 제어할 수 있도록

설계되었고 이는 상자성 비드를 사용하여 핵산을 유형과 크기별로 선택적으로

결합하는 검증된 SPRI 기술을 기반으로 하고 SPRIselect 시약의 간소화된 워크플로우

및 자동화 기능은 크기 선택 프로세스를 보다 간소화하고 오류 발생 가능성을

줄여 결과적으로 더 빠르고 안정적인 염기서열 분석 결과를 제공합니다.

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데이터 및 성능

SPRISelect 시약을 사용하여 E. coli 에서 전단된 gDNA에 대해

두 가지 크기 선택을 수행하고 크기 선택마다 세 번의 반복이 수행되었습니다.

세 번의 반복이 모두 매우 일정한 크기 선택 기능을 나타냈습니다.

(왼쪽) 왼쪽 크기 선택을 위해 샘플 비율 0.5x로 결합하고 (오른쪽)

오른쪽 크기 선택을 위해 샘플 비율 0.5x로 결합하고 DNA 크기는

Agilent 2100 Bioanalyzer 고감도 칩을 사용하여 측정하였고

43 및 115의 피크는 internal marker입니다.

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워크플로우 및 프로토콜


⊙ SPRIselect Left Side Size Selection 워크플로우

⑴ DNA를 자성 비드에 결합

⑵ 비드를 오염 물질에서 분리

⑶ 자성 비드를 85% 에탄올로 세척하여 오염 물질 제거

⑷ 자성 비드에서 DNA를 용출

⑸ 새 플레이트로 이동

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⊙ SPRIselect Right Side Size Selection 워크플로우

⑴ DNA를 자성 비드에 결합

⑵ 상층액을 새 플레이트로 옮김

⑶ DNA를 자성 비드에 결합

⑷ 비드를 오염 물질에서 분리

⑸ 자성 비드를 85% 에탄올로 세척하여 오염 물질 제거

⑹ 자성 비드에서 DNA를 용출

⑺ 새 플레이트로 이동



Nucleic Acid Input

Fragmented DNA, PCR 제품 

Output 

선별된 사이즈의 DNA 

사이즈 선택 범위 

150 - 800 bp 

Bead Ratio 

사이즈 선택 : 선택 포인트에 따라 다름, 클린업 : 1.8X. 

Format 

액체 

Volumes 

5 mL, 60 mL, 또는 450 mL 

어플리케이션  

DNA 사이즈 선별, PCR 정제, NGS 클린업 

Processing mode 

자동 또는 수동 

Technology 

SPRI 상자성 비드 기반 기술 

Storage 

실온 보관